More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1664 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  49.54 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  50.5 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  47.19 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  40.95 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  41.41 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  37.16 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.69 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  35.14 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  39.13 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  34.23 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  36.26 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.15 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.62 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.28 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  36.48 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.51 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.59 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  34.49 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  35.99 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  33.65 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.22 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.77 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.57 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.79 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.38 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  35.44 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  31.41 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.43 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  35.64 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.75 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.75 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.32 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.84 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.67 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  33.67 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  35.35 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.04 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  34.64 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.58 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  33.54 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  37.97 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.68 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  35.31 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  34.08 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.57 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  33.9 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.16 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  34.9 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.61 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  34.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.85 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  35.45 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.82 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.33 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.52 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  32.57 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  31.8 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  35.34 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  34.56 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.53 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.05 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  34.2 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  32.64 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  36.4 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  34.8 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  31.13 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  35.04 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  35.99 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.19 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  35.74 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  33.66 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  30.82 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  36.03 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.59 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  34.93 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.59 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.55 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.27 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  32.22 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.3 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  35.33 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  31 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>