More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2008 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  56.52 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  53.67 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  53.54 
 
 		 351 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  46.69 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  40.48 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.24 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.82 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.22 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  41.43 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.34 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.08 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  38.26 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.46 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.13 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  36.59 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.78 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.19 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.21 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.57 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.77 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  34.34 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  35.4 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  34.34 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.8 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  33.77 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.11 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.26 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  33.97 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.82 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  34.67 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  35.14 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.78 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  34.49 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.18 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.16 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.17 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  36.07 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  33.66 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.13 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  33.45 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.9 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.47 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  34.17 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  38.44 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.99 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.13 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  35.91 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  35.91 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.61 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.89 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.05 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  34.8 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  34.74 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  35.22 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37.08 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  32.44 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  32.8 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.47 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  33.7 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  34.01 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  33.66 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  34.48 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.2 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  32.52 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.69 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.69 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.66 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  35.47 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.03 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  33.55 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.64 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  34.11 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  33 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  36.09 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.65 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>