More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5294 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 330 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  75.94 
 
 		 353 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  73.37 
 
 		 330 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  47.19 
 
 		 331 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  47.14 
 
 		 351 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  43.85 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  45.6 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  41.95 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  45.07 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  39.46 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  38.8 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  37.65 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  41.14 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.79 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.29 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  39.67 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.9 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.52 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.52 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  41.76 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.66 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.18 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.67 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.29 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  37.17 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.57 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.11 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.75 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.65 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.38 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.34 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.8 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  35.26 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  36.3 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.6 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  39.32 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  39.32 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.19 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  35.95 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  38.74 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.05 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.54 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.16 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.15 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  39.6 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.52 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.36 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  36.79 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.89 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.16 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  36.24 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.63 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  36.76 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  37.37 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.39 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  34.94 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.56 
 
 		 386 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.13 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  38.16 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  37.85 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.86 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  35.91 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.73 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  40.21 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  37.76 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  39.46 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  37.46 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.88 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.92 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  39.85 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  35.08 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.63 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.58 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  36.25 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.33 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.08 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>