More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4630 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 
353 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  77.54 
 
 
330 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  75.94 
 
 
330 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  50.49 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  46.13 
 
 
351 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  43.33 
 
 
325 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  42.28 
 
 
326 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  40.89 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  39.18 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.36 
 
 
330 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  39.74 
 
 
332 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.46 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.91 
 
 
322 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.04 
 
 
322 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.02 
 
 
325 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.76 
 
 
326 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 
358 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.08 
 
 
346 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.86 
 
 
328 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.19 
 
 
348 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.45 
 
 
334 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.66 
 
 
326 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.38 
 
 
327 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.38 
 
 
325 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  38.98 
 
 
356 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.27 
 
 
328 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  36.67 
 
 
327 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.15 
 
 
335 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  38.08 
 
 
325 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.16 
 
 
325 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  35.96 
 
 
326 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.05 
 
 
329 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.07 
 
 
335 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.54 
 
 
328 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.26 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  39.86 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.29 
 
 
328 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  40.73 
 
 
330 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.29 
 
 
328 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.43 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  37.58 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.75 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.17 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.17 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.15 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.8 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.65 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  34.41 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  36.65 
 
 
328 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  42.7 
 
 
329 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.86 
 
 
328 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.63 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.54 
 
 
339 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  35.99 
 
 
332 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.77 
 
 
327 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.99 
 
 
327 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.52 
 
 
322 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  38.03 
 
 
332 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.21 
 
 
331 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.87 
 
 
322 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  34.45 
 
 
329 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  37.62 
 
 
332 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.08 
 
 
331 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.76 
 
 
335 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.79 
 
 
324 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.08 
 
 
331 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  35.49 
 
 
330 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  37.58 
 
 
326 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  37.31 
 
 
386 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.69 
 
 
324 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  40 
 
 
333 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.86 
 
 
326 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.67 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 
328 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.81 
 
 
349 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.08 
 
 
337 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.2 
 
 
336 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.6 
 
 
304 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.01 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.47 
 
 
334 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  34.92 
 
 
326 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.79 
 
 
324 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  36.15 
 
 
324 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  35.37 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  35.74 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.64 
 
 
326 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  36.81 
 
 
338 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  36.61 
 
 
325 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  35.98 
 
 
344 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36.27 
 
 
325 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.59 
 
 
331 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.3 
 
 
327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>