More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3841 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  78.46 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  54.18 
 
 		 326 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  53.69 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  51.51 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  46.37 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  44.69 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  46.01 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  40.61 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.55 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.78 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.7 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.11 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.54 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  39.87 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.22 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.04 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.54 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.69 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  40.14 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  39.8 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.97 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.48 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  39.31 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.93 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.04 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.81 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.75 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  39.39 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.22 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.67 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.06 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.92 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.78 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  40.46 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  39.31 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.31 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  37.16 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.03 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.15 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.52 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  39.02 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.05 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.82 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.42 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.96 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.95 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  37.33 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.67 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.43 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.98 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.31 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.79 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  36.2 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.66 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.03 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.03 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.36 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.36 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  37.25 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.33 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.98 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.67 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  37.31 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  37.31 
 
 		 325 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  36.15 
 
 		 330 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  36.94 
 
 		 324 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.81 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.9 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.46 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.82 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.46 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.91 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  36 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.45 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.55 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.17 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>