More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6278 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  36.6 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  32.54 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.41 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13960  lysophospholipase  29.88 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.446365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.62 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.02 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.13 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 		 393 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.33 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  26.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.19 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.89 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.89 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 474 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.18 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  23.62 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.45 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 504 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  25.74 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.21 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.14 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  24.9 
 
 		 453 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  25.74 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  23.36 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.13 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  20.49 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.48 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  22.39 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  25.74 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.48 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.7 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  21.54 
 
 		 2063 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.85 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  25.65 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  25.65 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0870  alpha/beta hydrolase fold protein  20.87 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  20.08 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>