More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1566 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  553  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  40.62 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  38.06 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
282 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
262 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
262 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
283 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
283 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.56 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.07 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.73 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.48 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.94 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.02 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.69 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  24.15 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  25.69 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.29 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.63 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.12 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.12 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.12 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.12 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.12 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.43 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.91 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.07 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>