112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13960  lysophospholipase  100 
 
 		 251 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.446365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  32.16 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  31.25 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  31.84 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  38.66 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  32.5 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  29 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  29 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.06 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  30.96 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  30.57 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  28 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.35 
 
 		 367 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  31 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  28.95 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  29.9 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  29.74 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 317 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  27.63 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.58 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.29 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  33.18 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.62 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  32.79 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  26.2 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  26.67 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  25.93 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 		 370 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.85 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  29 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1973  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  26.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18350  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.01 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.525496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  29.68 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  27.52 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  35.85 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.03 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  21.61 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3348  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.44 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.73 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  21.01 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.32 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  32.68 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0331  BioH protein, putative  34 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>