27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5891 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  50.74 
 
 
339 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  44.03 
 
 
330 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  40.18 
 
 
334 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  40.87 
 
 
347 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  30 
 
 
332 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  32.72 
 
 
327 aa  101  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03087  hypothetical protein  26.32 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  27.99 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  22.65 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  31.86 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  22.95 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  31.25 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  23.56 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
248 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  31.19 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  23.26 
 
 
733 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.19 
 
 
250 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  23.66 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  37.97 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  29.82 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  37.97 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  26.96 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>