33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0544 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  673    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  54.27 
 
 
334 aa  348  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  43.99 
 
 
350 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  39.46 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  38.59 
 
 
347 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  32.82 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  34.07 
 
 
327 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  30.22 
 
 
323 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  25.48 
 
 
733 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03087  hypothetical protein  23.36 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  28.51 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.04 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  30.91 
 
 
332 aa  52.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  27.27 
 
 
258 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  27.23 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  20.39 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
249 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  26.22 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  26.9 
 
 
397 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  22.14 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  28.45 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  30.19 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
240 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  30.07 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  24.73 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  30.07 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  28.7 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  23.47 
 
 
397 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>