22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3079 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  54.27 
 
 
330 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  40.12 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  39.82 
 
 
339 aa  235  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  40.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  30.53 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  31.1 
 
 
332 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  29.97 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03087  hypothetical protein  25.54 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  24.9 
 
 
733 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  24.31 
 
 
345 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  27.59 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  22.05 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
240 aa  46.2  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  29.2 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  32.23 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  32.23 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
248 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>