20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3650 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  51.21 
 
 
350 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  39.46 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  39.82 
 
 
334 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  39.55 
 
 
347 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  33.49 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  38.96 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  26.44 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03087  hypothetical protein  24.69 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  25.79 
 
 
332 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  20.45 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  24.39 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  22.58 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  24.23 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
344 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  26.55 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
256 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>