51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1753 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  59.88 
 
 
335 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  59.08 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  57.55 
 
 
332 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  30.09 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  33.59 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  33.59 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  30.17 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  35.09 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  26.36 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  21.67 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  31.58 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  31.86 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  31.25 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.49 
 
 
736 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  27.8 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  36.36 
 
 
257 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.14 
 
 
736 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  30.43 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  30.36 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  30.83 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  26.15 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  30.43 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  27.17 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  25.28 
 
 
330 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  28.26 
 
 
253 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28 
 
 
238 aa  46.2  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0192  hypothetical protein  24.56 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  25.55 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  23.04 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  25.58 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  26.61 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  25.81 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  24.78 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  25.81 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  25.81 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  23.78 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  25 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  25.81 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  24.24 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  21.58 
 
 
299 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  31.37 
 
 
265 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
278 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>