67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1187 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5891  hypothetical protein  40.44 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0657809  decreased coverage  0.000828418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3650  hypothetical protein  40.31 
 
 
339 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0754933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  40.24 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0544  hypothetical protein  38.15 
 
 
330 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000261261 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0666  hypothetical protein  28.49 
 
 
327 aa  119  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3499  hypothetical protein  44.13 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03087  hypothetical protein  31.97 
 
 
319 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  42.47 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  25.52 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
240 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  24.83 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  35.71 
 
 
250 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  33.64 
 
 
260 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  31.58 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
249 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  23.57 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  30.6 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  36.73 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  29.19 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  36.97 
 
 
255 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
257 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  30.33 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  25.58 
 
 
733 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  27.08 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 
264 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.93 
 
 
736 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  27.08 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
277 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  34 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  35.09 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03006  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13070)  27.89 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  26.19 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  29.17 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  36.84 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  31.3 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  38.32 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  34.83 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  34.95 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.72 
 
 
736 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  34.44 
 
 
253 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  73.33 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  41.67 
 
 
286 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
296 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>