78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3324 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3324  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  100 
 
 		 379 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3475  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  70.48 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  52.28 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  49.58 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  49.01 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2031  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.229724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  28.05 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2250  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  27.3 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2208  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  27.01 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  25.07 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2374  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1484  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.97 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  25.8 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.23 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 411 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  28.63 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 		 472 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  28.15 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 480 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>