52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2374 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2374  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 377 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1484  twin-arginine translocation pathway signal  99.72 
 
 		 352 aa  707    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2208  twin-arginine translocation pathway signal  47.46 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2250  twin-arginine translocation pathway signal  47.35 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2031  twin-arginine translocation pathway signal  42.82 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.229724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  28.21 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  22.8 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  26.61 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  26.16 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.88 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3475  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.75 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3324  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.55 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  22.41 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  22.61 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  21.26 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  20.22 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  21.83 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  21.23 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  20.33 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  21.79 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.28 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  21.45 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  21.32 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  21.32 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  21.02 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>