55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2031 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2031  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 382 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.229724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2250  twin-arginine translocation pathway signal  58.82 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2208  twin-arginine translocation pathway signal  55.79 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2374  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1484  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  26.25 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  26.56 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3475  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.81 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3324  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.44 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  23.67 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  23.37 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.04 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  22.07 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  21.86 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.44 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  20.87 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  20.87 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  21.2 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  23.28 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  23.01 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  21.05 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  22.1 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  19.49 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  21.25 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  20.9 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  21.68 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.98 
 
 		 458 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  21.1 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  22.12 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  23.22 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  22.32 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  21.35 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>