56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2208 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2208  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 384 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2250  twin-arginine translocation pathway signal  76.56 
 
 		 381 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2031  twin-arginine translocation pathway signal  56.58 
 
 		 382 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.229724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2374  twin-arginine translocation pathway signal  47.98 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1484  twin-arginine translocation pathway signal  47.98 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.14 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.51 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3475  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  26.82 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3324  putative ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  27.51 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.72 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  20.84 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  20.89 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  22.63 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  21.59 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  20.57 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  20.11 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  20.32 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  20.8 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  21.41 
 
 		 411 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  21.25 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  20.32 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  20.77 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  19.39 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  22.25 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  21.56 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.07 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  20.51 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  21.8 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.7 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  22.9 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  19.87 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  19.56 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  21.99 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  20.06 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>