More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0793 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  90.34 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  68.75 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  68.75 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  68.46 
 
 		 144 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  58.27 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  58.99 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.83 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.83 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  59.85 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.33 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  58.33 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.94 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.26 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  48.97 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.36 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.36 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.42 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.77 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.36 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.14 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.89 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  44.44 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  44.44 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  45.59 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  43.75 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.18 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  44.36 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  37.31 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  46.43 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  43.15 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  46.32 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  44.12 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.46 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.99 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  41.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  39.57 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  41.43 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.86 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  37.23 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.16 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  42.19 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  40.58 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  37.88 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  37.88 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  37.88 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  38.76 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  37.86 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.25 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  36.18 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  37.41 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  37.5 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  37.06 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  37.06 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  39.1 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  39.26 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  39.26 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  36.76 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  35.81 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  35.81 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.65 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  32.56 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  37.3 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  36.49 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>