More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0244 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.56 
 
 
154 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  56.82 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.24 
 
 
145 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  50 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  50 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
144 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
144 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.01 
 
 
148 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  48.94 
 
 
144 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  51.11 
 
 
142 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.36 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  53.73 
 
 
141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  52.86 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  52.86 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.38 
 
 
145 aa  130  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  53.12 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.35 
 
 
144 aa  129  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  50 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  51.41 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  51.41 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  49.64 
 
 
144 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.25 
 
 
142 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  54.55 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  48.94 
 
 
145 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.94 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  50 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  50 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  49.65 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  47.1 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  50 
 
 
150 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  44.9 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  45.89 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.21 
 
 
153 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.58 
 
 
150 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  45.21 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  45.21 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  45.21 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  40.91 
 
 
139 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  45.89 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 
147 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.39 
 
 
139 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.69 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.14 
 
 
149 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
149 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  45.07 
 
 
148 aa  103  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  42.19 
 
 
151 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  42.19 
 
 
151 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  48.55 
 
 
136 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  48.55 
 
 
136 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  45.26 
 
 
147 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  41.61 
 
 
148 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.52 
 
 
166 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 
152 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
144 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  45.93 
 
 
134 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.08 
 
 
150 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.86 
 
 
139 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 
151 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.41 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  44.53 
 
 
150 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  46.67 
 
 
142 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  44.53 
 
 
150 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  39.53 
 
 
139 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  42.54 
 
 
147 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  41.35 
 
 
152 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  45.45 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  38.85 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  43.48 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  40 
 
 
152 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  42.64 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  38.19 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  44.44 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  42.86 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  43.65 
 
 
173 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  43.26 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  45.39 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  42.54 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  43.41 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  37.98 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  46.67 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  46.67 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  42.19 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  40.28 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  45.93 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  49.22 
 
 
157 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>