More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3121 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  100 
 
 		 142 aa  276  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  63.83 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  65.22 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1066  TolR protein  63.04 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  45.39 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  46.53 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  46.32 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.01 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  46.27 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  41.84 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  44.12 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  40.71 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.27 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  44.09 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.85 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  42.54 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  42.54 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.29 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  47.1 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  44.12 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  44.12 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  42.34 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  43.61 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  44.44 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  43.61 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  43.38 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  43.31 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  40.77 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.38 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  41.84 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  41.73 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  41.73 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  44.62 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  38.03 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  39.01 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  39.84 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  44.44 
 
 		 148 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  39.84 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  39.01 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  38.93 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  40.16 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  41.48 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  44.72 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  41.45 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.17 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  44.12 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  40.29 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  39.01 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  39.26 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  40.94 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.44 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  40 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.26 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.58 
 
 		 167 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  40 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  42.06 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  38.46 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.23 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  38.46 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  37.4 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  42.06 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>