More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0753 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 144 aa  292  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  54.14 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  50 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.85 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  45.59 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  46.27 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  44.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  47.76 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  48.8 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  44.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  45.8 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  48.8 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.66 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  47.01 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  51.11 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.47 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  47.58 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.66 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.58 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  53.66 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  55.28 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.41 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  45.45 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.52 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  43.54 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 166 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.62 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  44.96 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.61 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.92 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  44.35 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.77 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.15 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  44.35 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  44.26 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  48.44 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  43.9 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  43.9 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.55 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  47.46 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  43.31 
 
 		 169 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  41.67 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  38.57 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  43.2 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  43.2 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  43.2 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  39.26 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  39.26 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  41.54 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  41.54 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  37.68 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  40.46 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  39.69 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.98 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  39.86 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  40.15 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  38.41 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  43.8 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  39.53 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  37.68 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  42.97 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  41.73 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  43.2 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  36.96 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  40.94 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  36.96 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  37.69 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.77 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  43.8 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  40.62 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  40.62 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>