More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2418 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.54 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  65.55 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  65.55 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  64.71 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  61.16 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  56.43 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  63.03 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  64.46 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  57.5 
 
 		 151 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  57.5 
 
 		 151 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.25 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.2 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  57.5 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.98 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.4 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.68 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.02 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  57.02 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.35 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  52.38 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.94 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.53 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  47.15 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  47.15 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.97 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.83 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.83 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  44.44 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  49.6 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  47.01 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  50.41 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  47.5 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  43.97 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  43.97 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.97 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  41.32 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.53 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.13 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  41.27 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  45 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  45.58 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  40.32 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  41.73 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  43.44 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  41.06 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  41.67 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  46.28 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  40.15 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  39.34 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.31 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  41.73 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  40.83 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  40.83 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  41.3 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  41.01 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  41.01 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  45.3 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  39.29 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  39.29 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.4 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.63 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  42.03 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  42.14 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  41.3 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  40.8 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  38.41 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  39.86 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.5 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  41.3 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  39.86 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  39.39 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>