More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0861 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  100 
 
 
152 aa  306  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  77.21 
 
 
139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.74 
 
 
139 aa  201  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  63.19 
 
 
146 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.35 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  57.72 
 
 
138 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.98 
 
 
158 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.94 
 
 
137 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.54 
 
 
144 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  46.43 
 
 
144 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  44.62 
 
 
139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  43.55 
 
 
139 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  43.75 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.29 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  41.61 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  39.42 
 
 
143 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 
152 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  44.72 
 
 
139 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
139 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
147 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  41.13 
 
 
151 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
131 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  41.13 
 
 
151 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.8 
 
 
155 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 
155 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  37.5 
 
 
140 aa  101  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  41.79 
 
 
147 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  39.47 
 
 
150 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  39.47 
 
 
150 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  38.82 
 
 
150 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  41.67 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  42.96 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  42.96 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  43.09 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  39.73 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.54 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  39.73 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  42.74 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  36.23 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  39.69 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  39.69 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  39.69 
 
 
153 aa  94  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  40.32 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  39.2 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  42.74 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.65 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  37.21 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  38.97 
 
 
148 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  44.54 
 
 
142 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
151 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  36.67 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  36.76 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  43.7 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  42.42 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  42.42 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  43.7 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  40.16 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  33.09 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  37.78 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  37.78 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  38.58 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  43.7 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  43.7 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  39.23 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  42.02 
 
 
141 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  35.33 
 
 
150 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 
159 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  37.04 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  39.83 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  37.06 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.13 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.42 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  41.01 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  36 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  37.68 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  39.13 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  36 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  36 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 
149 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>