More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0560 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  95.27 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  95.27 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.76 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.47 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  73.13 
 
 		 134 aa  186  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.92 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.25 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  58.46 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.69 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  52.8 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  53.66 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  53.66 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  52.21 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  54.47 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  54.47 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.14 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.56 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.73 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.97 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  49.59 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  48 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.21 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  47.3 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.12 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  48.76 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  47.97 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  43.51 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  47.37 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.27 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  46.34 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  43.51 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.61 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.19 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  47.62 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  45.9 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  47.62 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  44.62 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  41.61 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.75 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  48.78 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  42.75 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.97 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.57 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  44 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  42.14 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.2 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  44.14 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  41.98 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  45 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  45.45 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  42.25 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  41.22 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  41.22 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  41.22 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  43.45 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  41.22 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  47.06 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.34 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  39.69 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  44.09 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  44.09 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  39.2 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  42.52 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  42.4 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  41.22 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  41.3 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  41.3 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  39.1 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  40.91 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.22 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.22 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>