More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5304 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.99 
 
 		 149 aa  261  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.99 
 
 		 149 aa  261  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  87.76 
 
 		 148 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  84.8 
 
 		 145 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  77.7 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.35 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  51.68 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  51.68 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  51.01 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  56.1 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.66 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  53.6 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.02 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  56 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  47.83 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  55.37 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  55.37 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  52.89 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.87 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.41 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.89 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  43.18 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  45.53 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  42.57 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  44.63 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  44 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  45.08 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  42.98 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  42.98 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  44.92 
 
 		 177 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  44.09 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.15 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  46.61 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  45.76 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  40.91 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  41.54 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  43.08 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.16 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  43.94 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.76 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  37.12 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  43.31 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.61 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  45.38 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  46.61 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  37.88 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  40.5 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  37.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  46.61 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  43.75 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  37.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  37.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  41.54 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.42 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  41.94 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  44.07 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  44.17 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  45.38 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  36.09 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.54 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  41.53 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.76 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  44.19 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  43.22 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  39.73 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  39.52 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  45.38 
 
 		 164 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  38.46 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  38.46 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>