More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1617 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  96.73 
 
 		 153 aa  297  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  75.89 
 
 		 158 aa  204  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  68.79 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  66.9 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.35 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  50.74 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  51.91 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  45.93 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.94 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  46.34 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.76 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  47.54 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  47.45 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.57 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  43.97 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  43.97 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  44.93 
 
 		 167 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.9 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  48 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.67 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.96 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  48.84 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.6 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.31 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.06 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  43.38 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  43.33 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.7 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  46.67 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  42.86 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  42.86 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.76 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.03 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  44.63 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  44.63 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  44.54 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  41.61 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.4 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  40.41 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.88 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  40.74 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  41.48 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  40.74 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  43.85 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  40.46 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  43.41 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.15 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.83 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  42.75 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  39.33 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  41.73 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.18 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  40.28 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  39.19 
 
 		 177 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.36 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  38.93 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  39.57 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  38.93 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.31 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  42.97 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  42.22 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  46.4 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  44.26 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  43.31 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  38.56 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  42.28 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.54 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  41.01 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  42.62 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.93 
 
 		 133 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0921  biopolymer transport protein, ExbD  42.97 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.03 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  36.99 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0174  TonB system transport protein ExbD  37.04 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  38.58 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>