More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0705 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
152 aa  304  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  83.89 
 
 
150 aa  256  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  83.89 
 
 
150 aa  256  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  83.89 
 
 
150 aa  256  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.48 
 
 
156 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  47.76 
 
 
139 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.66 
 
 
144 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  47.01 
 
 
139 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  47.14 
 
 
139 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  47.83 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.43 
 
 
139 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  44.12 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  47.14 
 
 
143 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.39 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.57 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  42.19 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  48.82 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.44 
 
 
141 aa  110  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.01 
 
 
139 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 
144 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  42.31 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  42.31 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  44.35 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  45.52 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  44.35 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 
131 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.01 
 
 
140 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.55 
 
 
150 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  41.67 
 
 
146 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 
139 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.57 
 
 
153 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  44.85 
 
 
152 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.03 
 
 
159 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  43.17 
 
 
148 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  44.7 
 
 
141 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  38.41 
 
 
140 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  41.91 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
145 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 
143 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  43.17 
 
 
134 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  41.91 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.97 
 
 
136 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  43.09 
 
 
147 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 
154 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  43.17 
 
 
141 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.87 
 
 
173 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  38.89 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  41.54 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  38.89 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  39.37 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  42.14 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  42.14 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.31 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  42.14 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.54 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  37.41 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  42.14 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  40 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  40.91 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  40.91 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  41.43 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  43.8 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.6 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  42.75 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  43.9 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.17 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  42.52 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.17 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  42.19 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.19 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  37.59 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  38.97 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  41.94 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.54 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.69 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
140 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.46 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
144 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
140 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
144 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  40.65 
 
 
141 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  40.44 
 
 
144 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
144 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
142 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  40.44 
 
 
144 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
148 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>