More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0690 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  93.62 
 
 		 141 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  93.62 
 
 		 141 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  92.91 
 
 		 141 aa  267  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  92.91 
 
 		 141 aa  267  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  92.91 
 
 		 141 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  86.52 
 
 		 141 aa  258  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  71.22 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  71.22 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  69.5 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  68.79 
 
 		 141 aa  213  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  67.86 
 
 		 143 aa  209  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  67.86 
 
 		 143 aa  209  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  67.86 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  70.21 
 
 		 142 aa  209  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  69.5 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  68.79 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  69.72 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  65.49 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  64.79 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  64.79 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  64.79 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  65.69 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  60.99 
 
 		 169 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  62.4 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.4 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  60.87 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  55 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.2 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.8 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.24 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  59.06 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  57.81 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  63.03 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.09 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  56.93 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.2 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.49 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  53.19 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  54.35 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  52.21 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  54.68 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0726  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.31 
 
 		 187 aa  143  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.56 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  52.82 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1667  TonB system transport protein ExbD  60.99 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1613  TonB system transport protein ExbD  60.99 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.1 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  52.89 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.91 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0300188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.28 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  54.47 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  52.55 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.54 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.47 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.76 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.76 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0921  biopolymer transport protein, ExbD  54.55 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0174  TonB system transport protein ExbD  45.99 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.97 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.86 
 
 		 136 aa  110  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3696  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.24 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  41.48 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  41.48 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  41.48 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  45.97 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  46.72 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  42.15 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  38.78 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  42.98 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  38.52 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.9 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  41.94 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  41.32 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  42.86 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.53 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.34 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  44.54 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  42.02 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  42.02 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.53 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>