More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3514 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 151 aa  300  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  92.72 
 
 		 151 aa  254  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  78.74 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  71.09 
 
 		 152 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.36 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  61.11 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  60.32 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  60.32 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.47 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  52.7 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  56.35 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  53.38 
 
 		 167 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  51.97 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  55.2 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  56.45 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  57.26 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  55.28 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  55.28 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  53.54 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.74 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  57.26 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.89 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.41 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.24 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.24 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.87 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.22 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.75 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.41 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  52.31 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.31 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.08 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.17 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  45.67 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.61 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  43.61 
 
 		 139 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.36 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.03 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  42.31 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.39 
 
 		 162 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  45.97 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  45.24 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  45.24 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  47.58 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  44.44 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  45.24 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  44.44 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  45.16 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  41.46 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  41.73 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.16 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.84 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.85 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.85 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.85 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  42.66 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  46.77 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  42.66 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  43.9 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  42.75 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.85 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.85 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  44.72 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1810  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.58 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  44.93 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  40.29 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  41.38 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  40.29 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  39.19 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  43.07 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  48.74 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  45.53 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1309  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4149  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.35 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0266463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  44.35 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.35 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  44.72 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>