More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0146 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  42.67 
 
 
152 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.4 
 
 
149 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  37.09 
 
 
167 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  42.75 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  43.75 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.77 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  43.75 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  44.09 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  42.74 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 
166 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 
149 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.16 
 
 
151 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 
154 aa  103  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 
147 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 
149 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 
149 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  42.86 
 
 
155 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  40.32 
 
 
147 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  40.94 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  42.86 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.37 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  44.26 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  44.26 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  44.26 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  38.71 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  43.2 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  40 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  43.2 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  42.96 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.33 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  39.2 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 
162 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  40.16 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  42.28 
 
 
173 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.97 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  34.25 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  38.13 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  37.06 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  42.97 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.67 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.4 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  37.06 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  37.06 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  42.4 
 
 
141 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
137 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.75 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  41.86 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  34.03 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  33.33 
 
 
140 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  39.2 
 
 
134 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.3 
 
 
141 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  39.2 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  37.59 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  39.2 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  39.2 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.73 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  33.56 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.75 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  38.4 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.34 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  33.33 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  35.66 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  40 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.4 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.4 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  41.01 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  38.13 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  42.62 
 
 
156 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.2 
 
 
151 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  40.32 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.53 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1309  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  38.4 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>