More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1251 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  94.74 
 
 		 152 aa  289  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.33 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.1 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  47.41 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  47.41 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  43.54 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  42.57 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.57 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.5 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  42.18 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  42.18 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  42.18 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  42.86 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  42.86 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  42.86 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  44.22 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  44.22 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  38.62 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  38.62 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  38.62 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  40.71 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  40.29 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.73 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  40.97 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.79 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.93 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.57 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  37.96 
 
 		 167 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.67 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  39.01 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.44 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.44 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  43.41 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  43.41 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  38.64 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.6 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  40.14 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.46 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.54 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  37.14 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  38.64 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  38.06 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.13 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  37.5 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  39.58 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  38.46 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  41.01 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.86 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1066  TolR protein  36.84 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.51 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  40 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.73 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.24 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  38.73 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  36.18 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  36.57 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  36.57 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  36.36 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  35.07 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  41.54 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  36.43 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 166 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  37.59 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  33.8 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  37.04 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.32 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  39.01 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  38.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  40.28 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.21 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  38.1 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  37.21 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  37.06 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  37.5 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.24 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  37.41 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  34.88 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  38.35 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>