More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0725 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  65.19 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  67.42 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.5 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  61.76 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.76 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  61.76 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  61.76 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  60.27 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.5 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.27 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.27 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.29 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  61.31 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.04 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.04 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.12 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.04 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  58.04 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  57.25 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.52 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  54.96 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  50.76 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  49.26 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.38 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  50.38 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  48.53 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  46.48 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  46.48 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  45.65 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  45.65 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  49.25 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  49.25 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.37 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  47.55 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.59 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  47.18 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.78 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  44.36 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  44.14 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.14 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  45.77 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  45.65 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  45.31 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  45.11 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  43.07 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  43.07 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  40.41 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  40.41 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  41.89 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  40.41 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 		 166 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.78 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  40.27 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0260  colicin uptake protein TolR  42.45 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00469758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.55 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  41.35 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.22 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  40.29 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  40.15 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  40.15 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  36.88 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  40.6 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3089  colicin uptake protein TolR  42.86 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1247  colicin uptake protein TolR  42.86 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  38.58 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  37.24 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  37.04 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  41.67 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  38.64 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  38.64 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  40.46 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2904  colicin uptake protein TolR  42.11 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  37.12 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  36.88 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.81 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1395  colicin uptake protein TolR  40.88 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000355274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  38.17 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2870  colicin uptake protein TolR  40.88 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  34.59 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1066  TolR protein  40 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2958  colicin uptake protein TolR  40.88 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  37.24 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  37.12 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  37.24 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  37.24 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  37.24 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>