More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0745 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  100 
 
 		 140 aa  282  9e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  77.7 
 
 		 143 aa  225  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  78.1 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  84.8 
 
 		 131 aa  220  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  79.03 
 
 		 155 aa  205  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  69.92 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1713  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.69 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  hitchhiker  0.0021985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  52.31 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  51.52 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  50.76 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  52.63 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  50.39 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.83 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  44.83 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  44.83 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  46.77 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.66 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  46.09 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.04 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  45.16 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  45.16 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.53 
 
 		 166 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  45.45 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  48.82 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.26 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  42.28 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  42.28 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.66 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  43.75 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  43.31 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  43.33 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  43.33 
 
 		 152 aa  106  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  37.96 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.28 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  103  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  44.26 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.9 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.62 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  43.44 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.32 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  38.71 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.9 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.9 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.9 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.9 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.9 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.9 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  42.62 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.97 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.9 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.62 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  42.19 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  40.16 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.1 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.84 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 		 145 aa  97.1  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  38.02 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  40.48 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  37.8 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  40.98 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  38.58 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>