More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2192 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  100 
 
 
142 aa  283  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.04 
 
 
145 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
154 aa  150  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  56.72 
 
 
139 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  52.45 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  52.45 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  52.14 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.4 
 
 
148 aa  143  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.71 
 
 
144 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.96 
 
 
145 aa  140  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  50 
 
 
145 aa  140  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.65 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.65 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  50 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.49 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.65 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.29 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.38 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  50.37 
 
 
146 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  49.65 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  49.26 
 
 
145 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  49.65 
 
 
144 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.65 
 
 
144 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  49.65 
 
 
144 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.2 
 
 
142 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.89 
 
 
142 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  51.85 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  50 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.98 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.81 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  47.33 
 
 
154 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.33 
 
 
154 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  48.3 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  46.26 
 
 
150 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  46.26 
 
 
150 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  51.09 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  51.09 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  45.58 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  45.58 
 
 
150 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 
150 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  48.51 
 
 
150 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  48.25 
 
 
151 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  48.25 
 
 
151 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  47.52 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  43.57 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.28 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  44.85 
 
 
136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  44.85 
 
 
136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  41.55 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  49.61 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
139 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  46.38 
 
 
147 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  42.86 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  38.52 
 
 
139 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  37.78 
 
 
139 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  44.93 
 
 
147 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
141 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  42.96 
 
 
142 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 
149 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
166 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  36.76 
 
 
139 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 
152 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  37.69 
 
 
150 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 
150 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  37.69 
 
 
150 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.2 
 
 
158 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
144 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.46 
 
 
141 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  38.52 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.64 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  38.64 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  34.11 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  36.76 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  37.4 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  39.37 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  37.4 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  38.3 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.13 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  35.88 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  40 
 
 
146 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  38.58 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  38.58 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  36.3 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  38.58 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  36.3 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  37.98 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  39.2 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  39.2 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  42.75 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  42.75 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
138 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.29 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 
149 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  41.3 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>