More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1896 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  100 
 
 		 148 aa  296  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  73.47 
 
 		 146 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  70.27 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  68.24 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.28 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  45.21 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.84 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.55 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.58 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  47.55 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  47.18 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.07 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  45.21 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  45.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  42.47 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  45.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  44.76 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.06 
 
 		 142 aa  103  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.07 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.32 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  47.18 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  45.45 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.69 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.78 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  46.43 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40.97 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40.97 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  41.84 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  40.43 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  45.07 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  45.07 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  39.44 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  42.86 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  38.85 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.54 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.19 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  40 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  36.11 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  39.19 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  38.51 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.51 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.85 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  42.45 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  38.51 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.88 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  38.51 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  35.97 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  38.51 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  35.97 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  43.51 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  38.93 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.51 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.92 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  42.75 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  41.01 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  42.75 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  38.41 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.93 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  32.61 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  41.06 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  38.1 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.81 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  37.68 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1066  TolR protein  36.81 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  36.23 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  34.78 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1395  colicin uptake protein TolR  39.13 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000355274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2958  colicin uptake protein TolR  39.13 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  34.27 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2870  colicin uptake protein TolR  39.13 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  36.69 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  37.31 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.51 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  38.35 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  34.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>