More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2145 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.94 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  48.18 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  44.76 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  48.36 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.68 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.3 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  44.35 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  42.15 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  39.6 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  43.31 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.9 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  39.26 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  39.39 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  39.52 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  40.44 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  37.16 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  37.69 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  41.32 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  41.27 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  41.67 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  37.6 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  36.14 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  36.92 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  36.92 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  41.67 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  41.03 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  41.67 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  37.9 
 
 		 145 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.26 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  42.54 
 
 		 142 aa  94  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  37.8 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  37.01 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  39.55 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  39.69 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.39 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  38.1 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.17 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.9 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  35.06 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  40.8 
 
 		 134 aa  90.9  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  35.94 
 
 		 145 aa  90.9  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  38.64 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.17 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.39 
 
 		 139 aa  90.5  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  36.51 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.43 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  36.51 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  36.51 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  42.64 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  36.51 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  38.33 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  38.46 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  36.57 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  35.61 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.61 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  35.61 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  37.82 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  39.26 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  39.26 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.32 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  35.71 
 
 		 141 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 		 136 aa  87.8  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.5 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 		 136 aa  87.8  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  36 
 
 		 139 aa  87.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  38.98 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 151 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>