More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2958 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2958  colicin uptake protein TolR  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1395  colicin uptake protein TolR  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000355274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2870  colicin uptake protein TolR  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1277  colicin uptake protein TolR  90.14 
 
 		 142 aa  233  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179595  hitchhiker  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3089  colicin uptake protein TolR  88.03 
 
 		 141 aa  223  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1247  colicin uptake protein TolR  88.03 
 
 		 141 aa  223  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2904  colicin uptake protein TolR  86.62 
 
 		 141 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1154  colicin uptake protein TolR  85.92 
 
 		 141 aa  216  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0842  colicin uptake protein TolR  81.69 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000118866  normal  0.967316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0873  colicin uptake protein TolR  81.69 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0231291  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0782  colicin uptake protein TolR  81.69 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000604041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0809  colicin uptake protein TolR  81.69 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.005244  normal  0.553409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0904  colicin uptake protein TolR  81.69 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000690537  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2897  protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000501773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0761  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  0.932499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0841  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2917  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0767  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000440347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00698  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  83.33 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000297247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1236  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048565  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00687  hypothetical protein  83.33 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000428395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0791  colicin uptake protein TolR  82.58 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.53707e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0660  colicin uptake protein TolR  83.33 
 
 		 142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000013266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0260  colicin uptake protein TolR  59.56 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00469758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  44.12 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  40.6 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  42.34 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  40.6 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  40.6 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  39.26 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  39.13 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  39.42 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.3 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  38.81 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  40.6 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.93 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  35.04 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  40.62 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  41.09 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  37.31 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  37.31 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  36.43 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.17 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  38.57 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  37.31 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  39.73 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  37.41 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  37.41 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  34.81 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  34.81 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  36.57 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  39.53 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  34.78 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  39.53 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  31.21 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  33.58 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.88 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.81 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.81 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35.88 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.76 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  33.57 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.88 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  36.72 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  36.72 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  35.34 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  33.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  33.59 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.37 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  36.22 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>