More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0573 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  46.34 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.8 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.74 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  43.48 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.75 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  42.54 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.75 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  42.75 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  42.75 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  42.75 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.53 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.03 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.15 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  41.46 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  38.06 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  43.38 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.57 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  42.14 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  42.06 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  42.62 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 		 166 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.17 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  38.03 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  38.03 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  45.31 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.03 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  43.2 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.03 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  43.08 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  40.94 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.77 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  38.52 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  38.21 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  42.52 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  39.02 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  40.98 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0912  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  37.88 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  37.88 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  39.13 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>