More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2772 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  99.29 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.21 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.19 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.03 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  48.95 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.84 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.59 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.62 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  51.08 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  48.92 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.26 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  42.11 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  43.94 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  43.18 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.09 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  43.57 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.86 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  46.15 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  46.15 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  45.38 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  41.61 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  44.7 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  38.41 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  38.41 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  41.79 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.28 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  40.28 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  40.28 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.69 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.73 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  38.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  37.41 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  38.06 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  40.62 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  44.44 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  40.71 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  36.72 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  41.67 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  35.95 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  35.56 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  39.23 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  37.78 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  37.68 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  35.95 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  39.84 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  36.62 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  40.62 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  38.46 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.18 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  40.31 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  38.46 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>