More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0733 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  100 
 
 		 144 aa  283  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  95.8 
 
 		 144 aa  249  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  95.1 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  63.31 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.31 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.31 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  63.31 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.31 
 
 		 149 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  63.31 
 
 		 149 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.31 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  61.87 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  63.31 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  67.44 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  68.46 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  62.88 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.85 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  59.85 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.47 
 
 		 139 aa  136  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.01 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.39 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  47.1 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  47.1 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  46.38 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  44.2 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.45 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  40 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.78 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.88 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  43.48 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.54 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  42.03 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.74 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  42.96 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  45.11 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  44.2 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.07 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.66 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.3 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  42.66 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  40.29 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40.69 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40.69 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  39.57 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  45.11 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  37.41 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  42.48 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.48 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  40.77 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.87 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  40.31 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  40.77 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.55 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  37.5 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  40.94 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.46 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  41.5 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  38.73 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  38.89 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.74 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  37.59 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.26 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  36.51 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  37.12 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.05 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  39.23 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  39.86 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  39.86 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  40.82 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  39.1 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  38.57 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  38.1 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>