More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0305 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  94.96 
 
 		 139 aa  267  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  57.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  57.34 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  56.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  57.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.34 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.33 
 
 		 148 aa  143  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  58.33 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  59.09 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  56.25 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  56.25 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  55.04 
 
 		 144 aa  127  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.16 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  45.74 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.61 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.92 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.99 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.26 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.46 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  41.3 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.23 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  41.91 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  36.57 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  41.91 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  41.91 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  42.42 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  43.7 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  41.73 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  42.74 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.88 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  44.35 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  41.84 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  38.97 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  40.32 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  36.88 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  39.52 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  38.28 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  41.94 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  38.28 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.74 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  37.88 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  38.19 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  35.62 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.06 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  36.76 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  36.22 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.28 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  38.62 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  39.37 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  39.37 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  37.3 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  41.13 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.85 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  41.13 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  41.13 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  39.52 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>