More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4795 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.57 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.03 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.32 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.07 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.07 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.35 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  50.36 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.01 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.84 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  42.86 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.1 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  40.91 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  40.91 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  38.35 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.54 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  40.77 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40.58 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40.58 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.17 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  40.91 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  42.22 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  37.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  42.03 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  36.88 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  36.55 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.55 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.85 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  38.52 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  36.88 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  36.88 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  37.5 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  37.67 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  37.86 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  40.15 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  37.96 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  37.96 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.74 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.53 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.53 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  36.84 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.17 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  37.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  35.51 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  39.55 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  33.79 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  33.79 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.25 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  34.59 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  36.23 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  32.35 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  34.65 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  36.99 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  34.65 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  33.1 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>