More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2510 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  91.21 
 
 		 307 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  76.08 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  52.82 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  54.9 
 
 		 311 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  52.58 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.31 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  51.94 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  51.61 
 
 		 310 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  51.94 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  51.61 
 
 		 310 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  54.4 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  48.04 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  50.98 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  295  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  50.98 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.98 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  50.98 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.64 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.64 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  50.64 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  53.22 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.22 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  47.12 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.05 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  52.65 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  46.89 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.53 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  43.61 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.92 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.26 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  39.87 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.21 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.19 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.85 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.71 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  41.81 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  42.37 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  41.95 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  42.95 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  40.68 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.64 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.47 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.75 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  43.77 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.47 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.25 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  42.56 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  37.79 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  42.14 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.68 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  44.15 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.72 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  43.01 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.46 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.89 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.77 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.99 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.95 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.69 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.67 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.8 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.56 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  41.83 
 
 		 153 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.97 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.84 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.84 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.56 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.42 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  33.99 
 
 		 172 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.56 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  30.91 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.39 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.37 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.46 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.39 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  27.97 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  29.97 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  29.97 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  29.97 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  32.19 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>