More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4769 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  88.75 
 
 		 311 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  66.12 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  65.02 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  67 
 
 		 316 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  67.11 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  67.11 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  66.01 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  66.89 
 
 		 308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  66.89 
 
 		 308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  68.03 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  65.46 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  65.79 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  64.47 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  68 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  64.55 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  67.34 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  67.34 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  67 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  66 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  66 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  66 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  66 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  57.19 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  49.67 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  49.67 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  47.33 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  40.07 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.6 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.58 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.8 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  31.02 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.61 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.7 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  29.83 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.91 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.36 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.36 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  32.9 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.95 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.99 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.33 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.36 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  31.05 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.05 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.05 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.72 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  36.96 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.83 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.57 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  30.72 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  30.72 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.8 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.72 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  33.33 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.72 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  32.99 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.31 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.6 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  34.69 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  33.02 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.03 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.1 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.37 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  31.35 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.84 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.11 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.19 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.97 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>