More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3280 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 312 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  45.91 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.91 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.91 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  46.98 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  45.4 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  47.47 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  46.86 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.94 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  44.62 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.62 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  44.62 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.62 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  44.62 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  44.62 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.62 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.3 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.3 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  43.41 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.98 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  41.83 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  42.53 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.86 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.73 
 
 		 298 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.43 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.6 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  42.45 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  40.97 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.4 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  39.23 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.46 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.46 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.64 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.38 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.74 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  37.25 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.86 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  38.59 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.59 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  39.2 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  36.81 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  39.14 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  42.13 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.9 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.24 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.32 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.22 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.32 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.77 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  33.98 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  35.77 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  35.77 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.11 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.96 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.33 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  34.44 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.13 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  30.64 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.84 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  33.46 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.21 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  30.9 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.35 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.66 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.56 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.56 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  28.52 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.05 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  29.85 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  33.09 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  33.09 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.04 
 
 		 250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  32.71 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  28.52 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>