More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2321 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  66.01 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  63.25 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  49.33 
 
 		 304 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  50.17 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.1 
 
 		 295 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  49.17 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  43.88 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  43.15 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  43.2 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.48 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.2 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  40 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.68 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.92 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  39.46 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.46 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.66 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  37.62 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.66 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.6 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  38.28 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  35.14 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  37.95 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.51 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.74 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  40.46 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.19 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  36.63 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.41 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  38.89 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  43.68 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.39 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.39 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  36.51 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.25 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.4 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.25 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  34.12 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  42.05 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  34.09 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.89 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.1 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  37.5 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.97 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.91 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.84 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.7 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.94 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.27 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.27 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.64 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  32.6 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  32.6 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.85 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.36 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.6 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.6 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.97 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.09 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  30.66 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.58 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  41.48 
 
 		 153 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.05 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1005  PfkB domain protein  33.73 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  35.33 
 
 		 172 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>