More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0260 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
325 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.61 
 
 
298 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  42.91 
 
 
312 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  46.13 
 
 
326 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.42 
 
 
309 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.34 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  40.97 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  40.97 
 
 
309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  40.97 
 
 
309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  40.97 
 
 
310 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.66 
 
 
309 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.83 
 
 
296 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  40.97 
 
 
310 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.47 
 
 
311 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  44 
 
 
311 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  42.76 
 
 
325 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.87 
 
 
322 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  40.65 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.74 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  39.35 
 
 
310 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.33 
 
 
331 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  41.75 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.22 
 
 
307 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.59 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.59 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.2 
 
 
309 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 
310 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 
313 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  41.14 
 
 
312 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  41.89 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  36.12 
 
 
309 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  36.86 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.22 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  39.73 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  40.8 
 
 
311 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.29 
 
 
318 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  33.87 
 
 
315 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.39 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.9 
 
 
312 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  34.59 
 
 
318 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  31.35 
 
 
307 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 
297 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  40.86 
 
 
302 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  38.33 
 
 
305 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  39.49 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.45 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.56 
 
 
299 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 
302 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  37.25 
 
 
306 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  34.44 
 
 
258 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  37.12 
 
 
306 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.9 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.26 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.67 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.62 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  34.55 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35.66 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.08 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  36.08 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.21 
 
 
311 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
301 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
301 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  29.9 
 
 
329 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  30.19 
 
 
316 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.85 
 
 
311 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  31.09 
 
 
308 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.51 
 
 
316 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.13 
 
 
309 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.08 
 
 
320 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  29.81 
 
 
316 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.73 
 
 
308 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.85 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.11 
 
 
314 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.73 
 
 
308 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
324 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  34.07 
 
 
319 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.86 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  31.6 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  27.95 
 
 
327 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  28.57 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  33.77 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
340 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.52 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>