More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0399 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  50.81 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  48.99 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.58 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  43.61 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.38 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.93 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.9 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.48 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  47.6 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  45.45 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.13 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  41.27 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  41.27 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.27 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.27 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  39.41 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.38 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  41.53 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.95 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.95 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  41.35 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  41.35 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.63 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  39.94 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  39.68 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.06 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  38.98 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  41.58 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.62 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  42.57 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.03 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.03 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.22 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.07 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  37.82 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  40.92 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  46.86 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.93 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  40.67 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.74 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  40.4 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  36.72 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  40.78 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.03 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  33.88 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  43.89 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.26 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.28 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.27 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  41.88 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  43.1 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  41.69 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  37.14 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.24 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  37.38 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  29.97 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.41 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.8 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.17 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  33.09 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.98 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.79 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.79 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.98 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.21 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.62 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  34.75 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  31.77 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.81 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.06 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.35 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.31 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  36.67 
 
 		 153 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>