More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5479 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  100 
 
 		 321 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  56.67 
 
 		 363 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  50.31 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  46.91 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  49.84 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  50.85 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  43.17 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  46.26 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  49.65 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.08 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  42.14 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  44.12 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  41.14 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  43.92 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.92 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  43.43 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.64 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  44.74 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  45.52 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  36.1 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  43.55 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.55 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  38.11 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  43.21 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  44.07 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.86 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37.79 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  42.7 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  36.79 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  39.4 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.44 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.33 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.67 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  37.81 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  40.58 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  40.75 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  37.62 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  37.18 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38.97 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.34 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  39.08 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  37.96 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  42.56 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  36.3 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.48 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  42.45 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.48 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  38.55 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.05 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  32 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.9 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  35.58 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  35.16 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.17 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  33.21 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.91 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.18 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  34.46 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  34.46 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  32.63 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  33.46 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.82 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  33.77 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.82 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.55 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.8 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.11 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.12 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  31.7 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.46 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.82 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.82 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.75 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  30.82 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>